Em 21 de dezembro de 1997, o Colégio de Aplicação passou a ser mantido pela Cooperativa Educacional Magna, sem fins lucrativos. Desde então, rege-se pelas disposições legais em vigor e pelas normas da autogestão adotadas pelo Sistema Cooperativista.
Em 2005, forma-se o Núcleo de Atividades Complementares no Centro de Concórdia, à Rua do Comércio, 449, para realização de provas e outras atividades necessárias. Além disso, formou-se um Núcleo de atendimento para o Ensino Médio no município de Seara, em local cedido pela prefeitura Municipal, junto à Escola Deolindo Zílio.
Em agosto de 2006, a CEM ampliou o Núcleo de Atividades Complementares, passando a oferecer aulas regulares de Educação Infantil e 1ª a 4ª série do Ensino Fundamental, tornando-se o Núcleo III da CEM, situado à Rua Oswaldo Zandavalli, 465. À época absorveu os alunos e os professores oriundos do Centro de Educação Infantil Brincarte e do Centro Educacional Girassol.
No final de 2006, junto ao Núcleo III, iniciou-se a construção da Minicidade Cooperativista, em parceria com a OCESC, a SESCOOP/SC, a Copérdia, o SICOOB e a CREDIAUC. No dia 4 de maio de 2007 foi inaugurada a Minicidade e neste mesmo ano iniciaram-se os projetos pedagógicos.
Em 2008, o Núcleo II, Seara, passa a funcionar à Rua São Daniel, 120, atendendo as turmas de Maternal a 3º Série do Ensino Médio.
No segundo semestre de 2009, o Colégio CEM amplia sua área de atuação e inaugura o Pré-CEM, curso direcionado a alunos que desejam se preparar para o vestibular.
No ano de 2011 a Cooperativa deixa de atuar no município de Seara, passando a centralizar seus esforços e trabalhos apenas no município de Concórdia, em dois endereços distintos: Núcleo I – localizado no Campus da UnC Concórdia, atendendo a alunos do Ensino Fundamental II e Ensino Médio; e Núcleo II – localizado no Centro de Concórdia, atendendo a alunos da Educação Infantil, Ensino Fundamental I e II, Pré-Vestibular, Cursos Livres, Centro de Idiomas e Período Complementar.
Em julho de 2012, foi sancionada a Lei 12.690, que regulamenta o Ato Cooperado das Cooperativas do Ramo Trabalho. Por força desta Lei, a Cooperativa Educacional Magna passa a ter a seguinte razão social: COOPERATIVA DE TRABALHO MAGNA.
Em janeiro de 2013 a CEM institucionaliza o Ensino Complementar, atendendo a crianças da Educação Infantil ao 3º Ano do Ensino Fundamental, no contraturno.
Em 6 fevereiro de 2017 a Cooperativa de Trabalho Magna inaugura sua sede própria, localizada à Rua Jonas Ramos, 461, concentrando atendimento ao Ensino Fundamental e Médio, bem como cursos livres. Com isso, encerra suas atividades na UnC e o Núcleo III, Rua Oswaldo Zandavalli, passa a ser exclusivo da Educação Infantil, permanecendo desta forma até os dias atuais.
Comemorações pelos 20 anos de história
A preocupação do Colégio CEM vai além das dimensões da sala de aula, pois também está voltada para o fortalecimento do ser. Recentemente, comemoramos 20 Anos de história, e esse amor por ensinar se tornou ainda mais forte e vivo entre os sócios da Cooperativa.
Acreditamos que por meio do Cooperativismo é possível desenvolver a educação integral do indivíduo, abrangendo não apenas o conhecimento formal e sistematizado, mas também a construção de valores que auxiliem para um convívio social mais humanizado.
Somos uma escola que utiliza o material didático do Sistema Positivo de Ensino para a Educação Infantil e Ensino Fundamental Anos Iniciais e Finais. No Ensino Médio, desde 2022 o Ensino Médio faz uso do material do Fleming. Nossa equipe pedagógica é formada por professores habilitados e capacitados, preocupados com a tarefa de ensinar e educar com amor.
Em 2022 o Colégio CEM completou 25 anos sucesso e crescimento.
